Helsinki vahvistaa Itämeren suojelua siirtämällä vesiensuojelutyön painopistettä yleisratkaisuista entistä tarkempiin kohdekohtaisiin toimiin. Kaupunki kartoittaa vedenlaatu- ja virtaamamittausten perusteella ne purot, joet ja pienvesistöt, joiden maaperän hiukkasten ja muiden kappaleiden kulkeutuminen vesistöön on suurinta. Näin kunnostus- ja suojelutoimenpiteet voidaan kohdistaa oikein.
Kaupungin luonnonsuojelualueohjelman tavoitteena on, että yli 10 prosenttia Helsingin merialueesta saa suojelustatuksen. Suojelu sisältää rannikko- ja merenalaisia elinympäristöjä, jotka ovat tärkeitä kalojen lisääntymiselle, linnustolle ja sukeltavalle pieneliöstölle. Suojelu ei tarkoita vesialueen virkistyskäytön merkittävää rajaamista, sanoo Helsingin kaupungin ympäristöjohtaja Miira Riipinen. Kaupunki ennallistaa myös matalia lahtia, rantaniittyjä ja meriajokasniittyjen vähentääkseen rehevöitymisen vaikutuksia.
Helsingin kaupunki on seurannut merialueiden vedenlaatua säännöllisesti jo 60 vuotta. Vedenlaadun seurannassa mitataan muun muassa veden lämpötilaa, näkösyvyyttä, suolapitoisuutta, happipitoisuutta, hapen kyllästysastetta sekä rehevöittävien ravinteiden, typen ja fosforin, pitoisuuksia. Kesäkaudella, huhtikuusta marraskuuhun, vesinäytteistä mitataan myös levän määrää.
Helsinki osallistuu Itämerihaasteen kautta yhteistyöhön Turun kaupungin kanssa. Kaupunki on ottanut käyttöön Itämeri-toimenpideohjelman 2024–2028, joka on neljäs yhteinen ohjelma Turun kanssa. Kaupunki pyrkii myös ottamaan vesivastuullisuuden huomioon kaikissa hankinnoissaan, olipa kyse rakennushankkeista kuin katujen ylläpidosta.